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新開発!小児血流感染症の病原微生物診断法~次世代シークエンスを応用して~ 研究活動 | 研究/産学官連携

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Academic year: 2018

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名古学大学大学院医学系研究科 研究科長 門松 健治 小児科学 伊藤 嘉規 い う

准教授 責任著者 川 潤一 わ い 講師 堀場 千尋 ほ

ひ 大学院生 筆頭著者 医学部附属病院 病院長 石黒 直樹 先端医療 臨床研

究支援センタ 奥 友介 く う け 特任講師 研究 プ 次世代シ

エンス 技術 用い 免疫不全状態 小児 け 血流感染症 血液検体 網羅的

病原微生物 遺伝子配列 検出 こ 原因微生物 特定 こ 確 ま

病気 そ 治療 免疫不全状態 患者 様々 病原体 感染症 ス

高く ま 感染症 篤 血液中 原因微生物 検出さ う ま

ま 長期 点滴治療 必要 場合 血管内 カテ テ 留置さ こ カテ

テ 経 症血流感染症 起こ ス 増えま こ う 症感染症 疑わ

場合 通常 血液検体 養 病原細菌 見 け 血液中 真菌 成分 検出

ウイ ス 核酸 検出 こ 病原微生物 診断 ま 現在 手法 幅広い

微生物 対応 複数 検査 並行 行う必要 あ 検査 採取さ 血液

検体 小児 負担 場合 あ ま

次世代シ エンス技術 ヒト 来 微生物 来 関わ 血液中 存在 い べ

遺伝子 塩 配列 解読 こ 既知 病原微生物 全 網羅的 検出

こ 可能 ま 本研究 次世代シ エンス 応用 血流感染症 病原細菌

判明 い 12症例 調べ こ べ 症例 病原細菌 遺伝子 検出 ま こ

う 2 例 原因細菌 感染症発症前 検体 検出さ ま 一方 血流感染症

う 原因不明 あ 23例中 3例 原因病原体 特定 ま 2例 細菌 1例 ウイ

ス 次世代シ エンス 少 血液検体 幅広い病原体 一度 特定 血液検体

微生物診断 役立 考え ま 本研究成果 科学 Scientific Reports 2018

2 月 28 日 英国時間 電子版 掲載さ ま

新開発!小児血流感染症

病原微生物診断法

(2)

新開発!小児血流感染症

病原微生物診断法

~次世代

クエン

応用

ポイン

○次世代シークエンスを応用 た病原微生物診断法を開発 血液培養 病原細菌 判明 い

血流感染症 同 細菌 遺伝子を検出 た 2例 発症前 血液検体 病原細菌 遺伝子を

検出 た

○原因微生物 不明 23例中 3例 病原微生物を新た 特定 た 細菌2例 ウイルス1例

○次世代シークエンス 網羅的 病原微生物診断法 有用 手法 あ

.背景

病気やそ 治療 免疫不全状態 た患者 様々 病原体 感染症 ク

高く 感染症 重篤 血液中 原因微生物 検出さ う た

長期 点滴治療 必要 場合 血管内 留置さ た こ

経由 重症血流感染症 起こ ク 増え こ う 重症感染症 疑わ 場合

通常血液検体 養 病原細菌 見 けた 血液中 真菌 成分 検出 た ウイ

核酸 検出 こ 病原微生物 診断 現在 手法 幅広い微生物 対応

た 複数 検査 並行 行い 微生物 同定 半数程度 限 た

検査 た 採取さ 血液検体量 小児 負担 場合 あ

次世代 クエン 技術 ヒ 由来 微生物由来 関わ 血液中 存在 い べ

遺伝子 塩 配列 解 こ た 既知 病原微生物 全 網羅的 検出 こ

可能 特 細菌検出 必須 血液 養 比べ 養 困難 細菌 診断 容易

真菌 ウイ 同定 可能 単一 方法 網羅的 病原微生物診断 可能

重症感染症 診療 大変 用 考え

.研究成果

本研究 次世代 クエン 応用 血流感染症 病原細菌 判明 い 12 症例 血

液検体 解析 た 細菌 関 血液 養 増殖 た菌 原因菌 推定 次世代

クエン 調べた場合 多く 種類 細菌 血液中 量 応 検出さ た 12例中8例

最 多く 遺伝子配列 検出 た細菌 血液 養 判定さ た細菌 一致 べ 症

例 病原細菌 遺伝子 検出 た こ うち 2例 原因微生物 感染症発症前 血液

中 検出さ た 一方 血流感染症 原因 不明 あ た23例中 3例 原因病原体 特

定 た 属菌 大腸菌 ア ウイ さ 次世代 クエン タ

(3)

.今後

展開

次世代 クエン 理論的 細菌 ウイ 真菌 既知 微生物全 検出 こ

可能 あ さ 遺伝子配列情報 薬剤耐性 解析 こ 次世代 ク

エン 血流感染症 診断法 臨床応用 こ 疾患 原因微生物 特定さ 病態

解明や治療法 改善 貢献 こ 期待さ

.用語

次世代 クエン

大量 DNA断 並列 クエン 塩 配列 決定 こ 従来 クエン 法

超えた大量 塩 配列 決定 解析技術 こ 配列決定 たDNA断 数

呼 単位 数え 少量 血液 1000万以上 得 こ 臨床応用

や神経疾患 け 遺伝子解析 先行 い こ 手法 微生物 解析 極

効 あ 理論的 少量 臨床検体 細菌 ウイ 真菌等 べ 微生物 存在

定量的 解析

血流感染症

広義 血液中 原因微生物 検出さ 重篤 感染症 意味 長期 点滴治療 必要

場合 血管内 留置さ た こ 経由 重症血流感染症

起こ ク 増え 関連血流感染症 原因 細菌 多く 血液 養 主

(4)

.発表雑誌

Kazuhiro Horiba1, Jun-ichi Kawada1, Yusuke Okuno1, Nobuyuki Tetsuka2, Takako Suzuki1, Shotaro Ando1,

Yasuko Kamiya1, Yuka Torii1, Tetsuya Yagi2, Yoshiyuki Takahashi1, and Yoshinori Ito1* 1 Department of Pediatrics, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan 2 Department of Infectious Disease, Nagoya University Hospital, Nagoya, Japan

" Comprehensive detection of pathogens in immunocompromised children with bloodstream infections by

next-generation sequencing "

Scientific Reports (英国時間2018年2 28日付け 電子 掲載)

DOI:10.1038/s41598-018-22133-y

English ver.

参照

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